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一種檢測農(nóng)田生態(tài)環(huán)境的高通量多重LDR分型試劑盒

  • 專利類型:發(fā)明專利
  • 有效期:不限
  • 發(fā)布日期:2021-06-26
  • 技術(shù)成熟度:已有樣品
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態(tài)核實
  • 簽署交易協(xié)議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(shù)(專利)類型 發(fā)明專利
  • 申請?zhí)?專利號 CN201010102179.3 
  • 技術(shù)(專利)名稱 一種檢測農(nóng)田生態(tài)環(huán)境的高通量多重LDR分型試劑盒 
  • 項目單位 東華大學(xué)
  • 發(fā)明人 趙麗亞,李凱,田俊策,葉恭銀,陳強,周宇荀,肖君華 
  • 行業(yè)類別 智慧健康-物聯(lián)網(wǎng)
  • 技術(shù)成熟度 已有樣品
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯(lián)系人 朱華黎
  • 發(fā)布時間 2021-06-26  
  • 01

    項目簡介

    本發(fā)明涉及一種檢測農(nóng)田生態(tài)環(huán)境的高通量多重LDR分型試劑盒,包括:農(nóng)田16種物種的線粒體COI基因通用引物,上游:5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′;下游:5′-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′;農(nóng)田16種物種的線粒體COI基因的特異探針序列;以及PCR擴增和LDR檢測程序所用試劑。本發(fā)明的試劑盒針對COI基因的通用引物有效擴增出所有目標物種序列,保證了各目標序列以及其中低拷貝的模板可被檢測到;各目標物種的特異探針進一步又保證了特異性,使各目標序列完全區(qū)分出來,實現(xiàn)多重分型定量,從而了解田間捕食結(jié)構(gòu)的變化,維護農(nóng)田生態(tài)環(huán)境。
    展開
  • 02

    說明書

    1.一種檢測農(nóng)田生態(tài)環(huán)境的高通量多重LDR分型試劑盒,包括:
    (一)PCR擴增體系
    (1)農(nóng)田16種物種的線粒體CO?I基因通用引物序列:
    上游:5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′;
    下游:5′-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′;
    (2)PCR擴增體系試劑

    (二)多重LDR檢測體系
    (1)農(nóng)田16種物種的線粒體CO?I基因的特異探針序列:
    擬水狼蛛,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTCCTGACATATCTTTTCCTCGAATAAA
    TAATC;
    R:P-TTTCTTTTTGGTTATTACCACCTTCTTTATTTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
    TTT-Fam;
    擬水狼蛛,產(chǎn)物長度121bp
    白背飛虱,LDR探針:
    F:TTGGAGCACCTGATATAGCTTTCCCCCGAATAAAC;
    R:P-AATATAAGATTTTGGTTACTTCCACCCTCCTTAAT-Fam;
    白背飛虱,產(chǎn)物長度70bp
    大螟,LDR探針:
    F:TTTTTTAGGAGCTATTAATTTTATTACAACAATTATC;
    R:P-AATATACGACTAAATAATTTATCTTTTGATCAAATT-Fam;
    大螟,產(chǎn)物長度73bp
    稻沼蠅,LDR探針:
    F:TTTTTTCAGCTCTTTTACTACTTTTATCATTACCTGTTCTC;
    R:P-GCTGGAGCCATTACTATGCTTCTTACGGATCGAAATTTTTT-Fam;
    稻沼蠅,產(chǎn)物長度82bp
    稻縱卷葉螟,LDR探針:
    F:TTTTTTTTCTATTATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTG;
    R:P-CCTTTAATATTAGGAGCCCCTGATATAGCTTTTCCTTTTTTT-Fam;
    稻縱卷葉螟,產(chǎn)物長度85bp
    稻縱卷葉螟絨繭蜂,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTGCCTTTATTATAATTTTTTTTATAGTTATACCAG;
    R:P-TAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAATTCCATTTTTTTTT-Fam;
    稻縱卷葉螟絨繭蜂,產(chǎn)物長度88bp
    桿蠅,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTGATTATTACCTCCTTCATTAACTTTATTAATG;
    R:P-GCTAGAAGTATAGTAGAAAATGGAGCTGGAACTGGTTTTTTTTTT-Fam;
    桿蠅,產(chǎn)物長度91bp
    褐飛虱,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTCAGGATTTATAGGAACCATAAGTAGTATAATTATC;
    R:P-CGATCAGAATTAACTCAACCAGGATCTCTAATTAATTTTTTTTTTTT-Fam;
    褐飛虱,產(chǎn)物長度94bp
    黑肩綠盲蝽,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTATCACATAATGGAAGATCAGTAGATTTAGCAATC;
    R:P-TTCTCACTTCACTTAGCTGGTATTTCATCAATTTTTTTTTTTTTTTTT-Fam;
    黑肩綠盲蝽,產(chǎn)物長度97bp
    黑尾葉蟬,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTAATAAGATCTATCATTGAAATAGGAGTG;
    R:P-GGAACAGGTTGAACAGTATACCCCCCCCTTTCAAGTTTTTTTTTTTTTTT-Fam;
    黑尾葉蟬,產(chǎn)物長度100bp
    灰飛虱,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTTTCGCTGGAGTTAGATCTATTATAGGAGCTATCAAC;
    R:P-TTCATTTCTACAATTATTAATATACGATCAAAAAATTTTTTTTTTTTTTTT-Fam;
    灰飛虱,產(chǎn)物長度103bp
    搖蚊,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTTTCTAGAAGTATAGTAGAAAATGGAGCAGGAACAGGG;
    R:P-TGAACTGTTTATCCTCCACTTTCATCTGGAATTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTT-Fa
    m;
    搖蚊,產(chǎn)物長度106bp
    薊馬,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATCGAAATTTGAACACTTCATTTTTTGATCCAAG;
    R:P-AGGAGGAGGGGATCCAGTACTTTACCAACACTTATTTTTTTTTTTTTTTTTT-
    Fam;
    薊馬,產(chǎn)物長度109bp
    水蠅,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAATAATATAAGATTTTGATTATTACCTCCTG;
    R:P-CATTAACTTATTTTATAGTAAGCAGTATAGTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT;
    水蠅,產(chǎn)物長度112bp
    蚜蟲,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAA;
    R:P-CTATACCAATTGTTATTGGTGGTTTTGGAAATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
    TT-Fam;
    蚜蟲,產(chǎn)物長度115bp
    二化螟,LDR探針:
    F:TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATCTTTAATTGGGGATGATCAAATTTATAATAC
    C;
    R:P-ATTGTTACAGCTCATGCATTTATTATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
    TT-Fam;
    二化螟,產(chǎn)物長度118bp;
    (2)LDR檢測體系試劑


    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種檢測農(nóng)田生態(tài)環(huán)境的高通量多重LDR分型試劑盒,其特征
    在于:所述的1×Taq?DNA連接酶緩沖液具體組分為:20mM?pH?7.6Tris-HCl,25mM?KAc,10
    mM?Mg(Ac)2,10mM?DTT,1mM?NAD和0.1%Triton?X100,緩沖液冷凍貯存。
    3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種檢測農(nóng)田生態(tài)環(huán)境的高通量多重LDR分型試劑盒,其特征
    在于:所述的混合探針的方案為將16個物種的特異探針以等濃度混合。
    展開

專利技術(shù)附圖

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